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脂肪酸は生合成を受ける際に炭素数が2個ずつ増加していくため、基本的には炭素数が偶数個の脂肪酸が大半を占めるが、α酸化を受けることによって炭素数が奇数個の脂肪酸が合成されることもある。不飽和度以外の分類方法は、以下にまとめる。なお炭素数による分類は別項を設ける。分枝脂肪酸?分子鎖を有する脂肪酸環状脂肪酸?環状構造を有するヒドロキシル脂肪酸?ヒドロキシ基を含む命名法脂肪酸の命名法はIUPAC生化学命名法1に定義されている。尚、この項の符号RuleLip-は同命名法の節番号を示す脂肪酸は天然の脂肪を加水分解して得られる脂肪族モノカルボン酸である。広く使用されている遊離脂肪酸(freefattyacids)や非エステル化脂肪酸(nonesterifiedfattyacids)という語が使用されているが、遊離や非エステル化という修飾語は徐々に廃止すべきである(Rule1Lip-1.1)。また、これらのアクロニムであるFFAやNEFAなどは使用すべきではない(Rule1Lip-1.14)。
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